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上傳模式及檔案

• 位址
  • 台灣杉1號
    • 140.110.148.11~12
    • 小型計算、無平行計算
  • 台灣杉3號
    • twnia3.nchc.org.tw(lgn1~4共4個節點共用一個domain name)
    • 平行計算功能
• 儲存空間
  • /home/$USERNAME (跨節點、100G、不能更改群組gid)
  • /work/$USERNAME (跨節點、100G、可提供群組使用)
  • 節點lgn301~4:/tmp/(arbitary) (100G、不能做為Slurm執行之IO、連同一節點也不能)
• OTP(one-time password)認證碼顯示、使用瀏覽器延伸功能快速複製OTP
• scp -r $USERNAME:$HOSTNAME_1:$PATH/$FILE $USERNAME:$HOSTNAME_2:$PATH

執行模擬

1. 由lgn303:/tmp/sinotec2複製所有內容到家目錄(~)
2. 工作目錄：~/cmaq_recommend/yymm
3. 設定起訖時間：~/cmaq_recommend/yymm/project.config
4. setting IO path and files(主程式):~/cmaq_recommend/yymm/run.cctm.03.csh
5. setting LD_LIBRARY_PATH:~/cmaq_recommend/exec.sh
6. prepare ocean.ncf:~/cmaq_recommend/work/2019-01/grid03/ocean/run.ocean.sh)
7. Start mpirun：~/bin/gorun.sh 200 run.cctm.03.csh，(詳見[[module_slurm#SBATCH]]
8. Link daily and combine：~/cmaq_recommend/combine.sh
9. 查驗執行情形
10. Compression：ncrcat -4 --cnk_map nc4 --cnk_plc all -L3 $RAWFILE $CMPRSFILE

後處理

1. 讀出combine.sh逐日檔其中之法規污染項目：shk.cs、ncrcat整合全月結果
2. 啟用python模組：module load pkg/Python/3.9.7
3. 計算濃度差異：dNC old.nc out.demo.conc.nc old-new.nc &
4. 時間空間的最大值：mxNC old-new.nc

Reference and Material

• 台灣杉3號lgn303:/tmp/sinotec2
• 教育訓練教材
  • 2022/4
  • 2023/5